A CBE tem como obtetivo centralizar o trabalho relativo à organização e divulgação de assuntos relacionados à estratigrafia no Brasil por meio dos seus membros com o apoio da Sociedade Brasileira de Geologia à qual é vinculada e de entidades os órgãos governamentais relacionados, como as Universidades Federais, o Serviço Geológico do Brasil (CPRM), a Agência Nacional de Mineração (ANM) e a Petrobrás Petróleo Brasileiro.